Sorumbático

Pois é, aparentemente, as últimas versões do gtk2 que saíram causaram um bug meio chato no eclipse, que é dos botões não responderem ao click. O pessoal já criou vários tickets de bug por aí, aqui vão alguns links pra quem quiser dá uma acompanhada: #441905, #441905 e #291257.

Felizmente, existe “solução de contorno” para tal problema, você deve configurar uma variável de ambiente antes de iniciar o eclipse:

export GDK_NATIVE_WINDOWS=1

E para isso ficar mais fácil, você pode fazer um script que configura essa varíavel e em seguida inicia o eclipse:

#!/bin/bash
export GDK_NATIVE_WINDOWS=1
/usr/bin/eclipse

Lembre-se de colocar o caminho correto para o binário do eclipse. Depois salve o arquivo e dê permissão de execução para ele:

chmod +x eclipse.sh

Pronto, agora basta você chamar esse script e seu eclipse vai funcionar como deveria de novo.