O removeItalic é um script em bash que você executa de qualquer pasta e simplesmente passa para ele o caminho (relativo ou absoluto) para a pasta onde estão suas legendas (.srt) e ele irá remover todos os <i> e </i> pra você. É ideal para quando há muitas legendas na mesma pasta.

#!/bin/bash
#
# Removes <i> and </i> from subtitles files
# Author: Marcelo Almeida
#         < marcelopazzo [at] gmail [dot] com >
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if [ "$1" ]; then
    path="$1"	# the path must end with a slash (/)
else
	echo -e "\a[USAGE] $0 <path>"
	exit 1
fi

ls -b "$path"*.srt | while read arquivo
do
	sed -i 's/<i>//;s/<\/i>//' "$arquivo"
done

exit 0

Estou pensando em fazer algumas alterações para poder pegar recursivamente qualquer arquivo .srt que esteja dentro de uma pasta, ou de qualquer uma de suas sub-pastas.